Es un organismo destinado a conservar todas las colecciones y fondos que se custodian en el Museo Marítimo Nacional, el Archivo Histórico y la Biblioteca Histórica de la Armada, manteniendo el control de los bienes culturales en cuanto a su estado de conservación, almacenamiento y exhibición. Para ello realiza diversas actividades que tiene relación con las áreas su competencia como son: la Conservación Preventiva, la Conservación Directa y la Restauración, las que se encuentran agrupadas en tres divisiones estratégicas:

DIVISIÓN CONSERVACIÓN

Conservación Preventiva: En esta área se monitorear la temperatura, humedad relativa, iluminación y contaminación de los depósitos y salas de exhibición.

Conservación Directa: Aquí se diagnostican, inspeccionan, limpian y almacenan en contenedores adecuados, las colecciones y fondos. Se impide la manipulación, traslado y exhibición de los bienes culturales en mal estado de conservación y se supervisa el montaje, desmontaje y movimiento,  de los objetos de la colección que serán exhibidos, tanto en la muestra como en exposiciones temporales.

DIVISIÓN RESTAURACIÓN

Restauración: En esta área se recupera con criterios de mínima intervención y reversibilidad, la materialidad y estética de los bienes culturales que son diagnosticados en mal estado de conservación. Ha de destacarse el trabajo metodológico de registro de los procesos de intervención, tanto en la documentación científica, que se sustenta en el conocimiento formal de la materialidad de los objetos tratados y la investigación histórica de las piezas que es realizada por los profesores de historia del Museo, en su respectiva división de colecciones.

Importante de mencionar es la restauración de un álbum fotográfico de la Aviación Naval, con fotografías en emulsión de gelatina y restauración de 97 manuscritos del siglo XIX, entre los que se destacan la carta de Carlos Condell a su esposa Matilde Lemus, fechada el 20 de enero de 1881, la comunicación firmada por el general don Manuel Bulnes al vencedor de Casma, capitán de navío Roberto Simpson del 22 de enero de 1839 y la carta dirigida a don Arturo Fernández Vial, sobreviviente de la "Esmeralda" por don Benjamín Vicuña Mackenna, fechada en julio 24 de 1883. Todo ello da cuenta de las capacidades en restauración de objetos de diversa materialidad que posee el Museo.

 Asesoría  y restauraciones a otras Unidades y Reparticiones de la Armada: Como efecto de la sensibilización que se ha logrado en las áreas de la conservación y restauración, se han solicitado y realizado innumerables evaluaciones, asesorías y restauraciones a diferentes objetos y documentos pertenecientes a  reparticiones y unidades de la Armada. Se menciona el Diagnóstico de conservación a 25 pinturas de la Comandancia en Jefe de la Armada en Santiago, la evaluación in situ al óleo del pintor Thomas Somerscales de la Comandancia en Jefe de la Primera Zona Naval que como acción a corto plazo se restauró en el Museo Marítimo Nacional y, gracias a un arduo trabajo de intervención, que se extiendió por cuatro meses, logrando rescatar esta obra en toda su magnitud.

Como parte de las actividades de evaluación de los Museos Navales se realiza el Diagnóstico de conservación del Museo Naval y Marítimo de Punta Arenas, analizando el edificio, los espacios disponibles, las condiciones de almacenamiento de los objetos y la tipología de las colecciones que se custodian en dicho inmueble. Estudio que concluye con la entrega de un acabado informe de las condiciones de conservación actuales en las cuales se encontraron las colecciones y su entorno, proponiendo tareas a corto, mediano y largo plazo, a fin de conservar el patrimonio histórico que allí se alberga. La importancia de este informe radica en que se pudieron gestionar los cambios necesarios para la habilitación adecuada de este museo en las áreas de conservación, tomándose todas las medidas que fueron propuestas para recuperar funcionalmente el inmueble, los espacios de almacenamiento, exhibición y conservación de la colección.

DIVISIÓN DIGITALIZACIÓN. Esta división tiene por objeto respaldar por medio de procesos de conversión digital, la información contenida en los fondos documentales y bibliográficos. Estos procedimientos requieren de exhaustivos y rigurosos controles, que conllevan una serie de acciones previas y posteriores como: selección, limpieza, preparación física del material, cotejo con el original, balance de tonalidades y control de calidad de las imágenes obtenidas.

OTRAS ACTIVIDADES AFINES Se organizan actividades de capacitación y conferencias relacionadas con la temática de la conservación, como es el caso de la conferencia dictada el 2004 sobre “Conservación, documentación y digitalización de colecciones fotográficas patrimoniales” dictada por expertos nacionales de la DIBAM y del Centro del Patrimonio Fotográfico, a todo el grupo académico y bibliotecólogos de la 1ª Zona Naval. 

Ha de destacarse que el Departamento de Conservación normaliza y organiza la colección de documentos que almacena el Departamento Archivo Histórico con más de 720 ítems, realizándose por primera vez un análisis que logra codificar toda la información y recuperación física del material definiendo, para cada tipología, un código específico. Este análisis, resume un trabajo metodológico donde se especifican los formatos estándar de almacenamiento dados por la diversidad de tamaños de los documentos y por la materialidad de ellos. Todo ello surge por la necesidad de conservar físicamente los originales. 

Otra de las acciones que coordina permanentemente este Departamento, son las visitas y clases del Taller de Restauración Fílmica de la carrera de comunicación audiovisual del DuocUC, en dependencias del Museo.  Paralelamente, se ha conseguido realizar seminarios y conferencias, relativas a la conservación de patrimonio y el participar o mantener vínculos con organismos nacionales e internacionales del área, como es por ejemplo el Centro Nacional de Conservación y Restauración (CNCR), la Asociación de Conservadores Restauradores de Chile (AGCR), El Comité Nacional de Conservación Textil, el Centro Nacional de Conservación de Papel de la Biblioteca Nacional de Venezuela, el International Center for the Conservation and Restoration of Cultural Property (ICCROM), entre otros.

Siguiendo en esta línea, el capacitar a los encargados de los Museos Navales de Iquique, Ninhue, Talcahuano y Punta Arenas, da cuenta de como ha ido tomando fuerza y se ha afianzando la conservación en la Armada, función que viene a establecerse como uno de los pilares de los deberes del Museo Marítimo Nacional que se establece hoy como Dirección Técnica de los Museos institucionales.